為了確保軟管微灌體系的正常運轉，延伸微灌設備的運用年限，關鍵是要準確運用、保護和杰出的辦理。
1．設備辦理
微灌設備的運轉辦理，有必要嚴厲遵從設備運轉的各項技術規范，準確地運用和保護微灌設備，初度運轉和換茬設備后，應對取水池（堰、渠、塘等）水泵、管路進行修理、試壓，以確保微灌設備的正常運轉。
2．保護和維護
對軟管微灌設備進行平常的查看和保護，維護是辦理工作的重要內容，也是確保設備常常處于杰出運轉狀況、延伸設備運用壽命的重要環節。因而，加強對設備的修理和維護顯得尤為重要。
（1）對蓄水池等水源工程要進行常常修理維護，堅持設備無缺。
（2）對蓄水池沉積的泥砂等污物應定時洗刷掃除。開敝式蓄水池的靜水中藻類易于繁衍，在灌溉時節應定時向池中投施綠釩，使水中的綠釩濃度在0．1～1．0ppm擺布，以避免藻類繁殖。
（3）水源中不得有超越0．8毫米的懸浮物，否則要設備過濾設備。
（4）對水泵要按水泵運轉規則進行修理和維護，在冬天運用時，注意避免凍壞水泵。
（5）微灌運轉期間，要定時對軟管帶進行完全的沖刷，洗凈管內殘留物和泥沙。沖刷時，翻開軟管帶尾端的扎頭或堵頭。沖刷好后，再將尾端扎頭扎好，進入正常運轉。
（6）每次灌肥、藥后，一定要灌一段時間清水，以清潔管道。
（7）每茬作物灌溉期結束，用清水沖刷后，將軟管從三通土取下。然后應將軟管常按棚、廂編號分別卷成盤狀，放在陰涼、避光、干燥的庫房內，并避免鼠咬損壞，以備下次運用。
（8）對微灌設備的附件，如三通、直通、硬管等，在每茬灌溉期結束時，三通與硬管銜接通常不要拆開，與軟管帶同時寄存在庫房內。直通與軟管通常不要拆開，可直接卷進軟管盤卷內。
（9）軟管卷盤時，原則上要按本來的折疊印卷盤，對有皺紋的地方應將整平后再卷盤。
（10）由于軟管帶壁較薄，通常只要0．2毫米擺布，因而，平常田間勞作和換茬保藏時，要當心操作，謹防劃傷、戳破軟管帶。而且卷盤時，好邊卷人邊走，不要遷延軟管帶。